医学部を目指し、Natureなど科学・医学記事を英語で読む

The sense of place in the immune system

語彙整理用です。

This series of reviews examines the effect of differing tissue environments on the activity and functional capacity of cells in the immune system. From their origins as hematopoietic stem cells, throughout their development and as mature cells, cells of the immune system find themselves in distinct and highly specialized niches, and contact with antigen or inflammatory signals changes their phenotype, activity and trafficking. Two-photon microscopy has provided the first direct observations of living cells and their activation choreography in the tissue environment and will no doubt continue to provide greater understanding of cellular dynamics and immune function.
[An abstract from "The sense of place in the immune system", Nature Immunology]
（全テキスト購入、購読はNature Immunologyへ）

受験必須用語
tissue：組織　（cell tissue=細胞組織）
immune system：免疫システム
stem cell：幹細胞
cellular：細胞(状)の
observation：【診療；其他】観察；生体観察
mature cell：【解剖】成熟細胞

[参考]その他の用語
hematopoietic stem cell：
(n)【解剖造血幹細胞】
hemat[=blood]/o/poietic[=creative] <　hematopoiesis(n)

niche
【疾患；基医】ニッシェ；ニッチ；適所；生態学的地位；壁龕

antigen(n)
抗原；アンチゲン；免疫原【薬化】

inflammatory(a)
【疾患】炎症性の；炎症性

phenotype(n) [phen/o/type]
【基医】表現型《遺伝子(群)によって発現された形質の型》；表現形；現象型；現象形；顕型；フェノタイプ

trafficking  < traffic(v)「通行する」「行ったりきたりする」

photon:〔物〕光子

microscopy:
顕微鏡使用(法)；顕微鏡による検査.

activation choreography：
？放射化[活性化]（減数分裂）記述法

mtDNA

ちょっと脱線気味ですが、用語の確認を。

New studies indicate that damage to the mitochondrial genome (mtDNA) accumulates with age, specifically in the dopaminergic neurons of the substantia nigra implicated in Parkinson disease. These findings suggest that mtDNA damage is important in the decay of dopaminergic neurons in aging and in Parkinson disease, resulting in loss of mitochondrial function and, ultimately, neuronal death.
[An abstract from "mtDNA clock runs out for dopaminergic neurons" , Nature Genetics]

(フルテキストは、＄１８で該当記事のみ購入するか、Nature Geneticsの購読が必要)

mitochondrial genome (mtDNA) :
ミトコンドリア中に存在する環状二本鎖DNA．自律的に複製するので細胞質遺伝現象の原因となる

genome:
生物が調和のとれた生活機能を営むために不可欠な，最小限度の遺伝子群を含む染色体の一組．それぞれの生物は固有の染色体基本数からなっており，1ゲノム内には相同染色体は含まれない．ヒトでは22本の常染色体と，1本の性染色体が1ゲノムに相当する

dopamine:
ノルアドレナリン，アドレナリンの直接の前駆物質であり，またそれ自体中枢神経系の神経刺激伝達物質などとして重要な生理的役割をもつカテコールアミン．中枢神経系においてはプロラクチン放出阻止因子あるいは黒質‐線条体系の伝達物質として機能していることが明らかにされたほか，精神分裂病に有効な向精神薬がいずれもドーパミン受容体の遮断作用をもつことから，この疾患との関連も注目されている．

dopaminergic neuron:
【解剖】ドーパミン作動性ニューロン

neuron:
ニューロン,神経細胞

substantia nigra:
【解剖】黒質

Death of Alzheimer victim linked to aluminium pollution

Brain autopsy of pollution victim rekindles contaminant fears.
Michael Hopkin

Fears of a link between aluminium and Alzheimer's disease have been reignited by the case of a British woman who died of the illness 16 years after an industrial accident polluted her local drinking water.

An autopsy on Carole Cross's brain showed that she was suffering from a rare form of early-onset Alzheimer's when she died in May 2004, and also revealed the presence of high levels of aluminium in her tissues. The researchers who investigated her brain cannot say whether the aluminium was the cause, but point out that the woman had no family history of dementia.

The polluting incident occurred in 1988 when a truck driver mistakenly emptied some 20 tonnes of aluminium sulphate --- used in the early stages of wastewater treatment --- into a tank containing drinking water destined for the village of Camelford in Cornwall, UK. An estimated 20,000 people may have been exposed to high levels of the chemical for several weeks.

Concerned residents are waiting to see whether more people will be similarly affected. Anecdotal reports state that several other villagers are suffering from dementia.

････snip･･･････
Aluminium is often found in the twists of deformed protein, called 'neurofibrillary tangles', that characterize the disease. But there is no strong evidence that it is involved in the disease's onset, Perl cautions. "I realize that's quite a conservative answer," he says. "But show me a couple more cases like this and I might have to change it."
["Once aluminium binds to proteins, it sticks for good. It's like trying to use superglue to mend a Swiss watch.", according to Daniel Perl,
Mount Sinai School of Medicine, New York]
[from [email protected]]

*autopsy=検死(postmortem),(死因究明のための)検死解剖；
rekindle=〈火〉を再びつける,…に再び火をつける.
*contaminant=《正式》汚染菌[物質].
reignite=〔…に〕再点火[再発火]する.r
*early-onset=初期症状
*tissue=細胞組織
*dementia=痴呆　＞senile dementia=老人性痴呆症
sulphate=【化】 硫酸塩[エステル].＿
treatment=処理　*[医療活動では「治療」「手当て」]
anecdotal=逸話の　ここでは住民の間で言われている話、位の意味か。　＜anecdote「逸話」
*neurofibrillary=neur/o/fibrillary→「神経」＋「原繊維(性)の」
conservative=控えめな、保守的な
(*は、医学、医療関連語）

Medical Terminology

医学用語など科学用語の用語法（Terminology）は、語源に由来する「語幹」を並べたり、接頭辞や接尾辞をつけたりするものです。
たとえば「用語法」は、'terminology'と言いますが、
これは、
termino+logy=語幹(word root)「術語」＋接尾辞(suffix)「学問or論」。また
termino=termin(語幹)＋o(連結母語)=termの連結形(combining form)
つまり、この言葉は、
（語幹＋連結母語）[連結形]＋接尾辞という構成になっています。

では、Nature関連の専門分野別の発行雑誌にNeuropsychopharmacologyがあります。
これは、
Neuro/psycho/pharmaco/logy
神経の/精神の/薬の/学問
で、「神経精神（病）薬理学」ということになります
最初の3つはともに「語幹」で、それぞれ最後がoになっているので、「語幹」＋「連結母音」＝連結形になっています。

ところで、先日「危険な」（言われている）売薬『ガスター10』は、「腹部」「胃」を表す、gasterあるいはgastrからとった名前ではないか、と言ったことがあります。正確には、gastero-が「腹部」、gastro-が「胃」の意味を表す言葉（語幹）の連結形です。ですから、gastrologyというと「胃病学」となります。ところがちょっと面白いのが、
intragastric=「胃内の」です。分解すると、
intra/gastr/icになります。「接頭辞」＋「語幹」＋「接尾辞」の構成です。
これまでとちょっと異なるのは、gastr/icの部分です。gastroではなく、gastrで、o「連結母音」がありません。これは、以下の「接尾辞」icが母音で始まっているからです。子音が重なっては発音しにくいので「連結母音」が加えられるわけです。

では、問題を一つ。今年のセンター試験でimmunityが注なしで使われていました。これは「免疫」という意味ですね。では「免疫学」はどう綴ればよいでしょうか。ちなみに、2004年に北海道大学の入試（前年に奈良女子大で出題）で出ていたimmune systemは「免疫系；免疫システム」です。

受験では医学用語をそれほど覚えることは求められないかもしれませんが、入学後は覚える必要に迫られることになるでしょう。ただ、医学部にしろ、他の学部にしろ、「語源」を知っておくと役に立つと思います。しかし、だからと言って「単語集」だけで暗記しても、弊害がでるだけです。読んだ英文に出てきた場合に、文章と関連付けて覚えるようにしましょう。

basic words --- 6

   Epidemics like people, and there are certain optimal numbers which make a population more susceptible to the rapid spread of an epidemic disease, such as Ebola or cholera or SARS. While these optimums vary according to specific diseases, in general, the higher the population density, the greater the chance that micro-organisms will make a successful transfer from host to host. This situation is true for both contagious and noncontagious infectious disease. In general, pest populations vary directly with the size of human populations within which they are located.
   Outbreaks of certain epidemic diseases may be related to certain controls. According to recent studies of disease history, the great plagues of Europe appear to be associated with high populations in relation to per capita production.
[2006　関西学院大（総合）IIの部分]

epidemics:[n]流行病
epidemic disease:流行性疾患；流行病【疾患】
Ebola (virus) :Ebolaはコンゴ民主共和国北部の川。
cholera:コレラ
SARS(severe acute respiratory syndrome)
micro-organism:微生物 《細菌・原生動物・酵母・ウイルス・藻類など顕微鏡によって観察される大きさの生物》
contagious:接触感染性の；接触伝染性の
infectious (disease):感染性の；感染；感染の【疾患】
plague:ペスト；悪疫

S.Korea's Hwang faked nine of 11 stem-cell lines: university

これは新聞記事ですが、Natureでもこの問題は取り上げられています。他にもこのところ論文、研究成果についての疑惑（東大なども）が問題にさせてるようです。ここまで高度化してくると一つ一つを検証できないからです。科学の問題はそれでも検証が可能な場合がまだ多いです。しかし、英語学習についてはいろいろなことが勝手に言われ、その多くが何の検証もなく垂れ流し、無批判に学校の授業などに取り入れられている現状は英語学習者にとっては由々しき問題です。

In a May paper in the journal Science, Hwang claimed to have created 11 stem-cell lines matched to patients in an achievement that raised hopes of creating tailored therapies for hard-to-treat diseases. But one of his former collaborators last week said nine of the 11 stem-cell lines were faked, prompting reviews by the journal and an expert panel at Seoul National University, where Hwang works.

The panel said Friday it found that "the laboratory data for 11 stem cell lines  that were reported in the 2005 paper were all data made using two stem cell lines in total."

To create fake DNA results purporting to show a match, Hwang's team split cells from one patient into two test tubes for the analysis --- rather than actually match cloned cells to a patient's original cells, the university said.

"Based on these facts, the data in the 2005 Science paper cannot be some error from a simple mistake, but must be seen as a deliberate fabrication to make it look like 11 stem-cell lines using results from just two," the panel said.

The panel said DNA tests expected to be completed within a few days would confirm if the remaining two stem-cell lines it had found were actually successfully cloned from a patient.
(from The Japan Times News Digest1)

1. 11 stem-cell lines:１１株の幹細胞

2. tailored therapies(=medicine)=テイラーメード医療：大別すると２つのアプローチがある。一つは患者一人ひとりの難病の発症を促す遺伝子異常を特定し、それを除去する方法。いまひとつがクローン幹細胞を用いて遺伝的に患者とそっくりな臓器を形成する方法。こうすることで、拒否反応の心配がなくなることが期待されている。

3. hard-to-treat diseases=難病

4. deliberate fabrication=故意の偽造

5. panel：ここでは大学の「調査委員会」

Natureを読む[April-1]

まず、読み易い記事からはじめましょう。医学、理学用語はあまり出てこないのですが・・・
なお、参加には、該当雑誌の講読が前提になります。
（Nature Medicineの場合は、学生は1,900円/月です。）

    The city's sewers each day soaks up its citizens' routines, taking in a steady stream of products. Toothpaste and shampoo may be harmless enough, but the waste also collects a wide array of medicines people take. Most drugs are poorly absorbed and metabolized by the body, so it is not unusual that the majority of a drug would end up intact in the urine. Because all water goes through toilets at some point, these artificial compounds, some quite difficult to break down, can eventually find their way into the city's water supply---even bottled water.
["Drugs down the drain", Nature Medicine, April,06]

1.　特に意識することはないですが、分詞構文

2.　挿入句

3.　関係代名詞の目的格の省略

などを確認しましょう。

語彙
artificial compounds

なお、この記事の記者によるコラム？"Toilet maker mines dedicines from waste"も面白いので読んでみましょう。

basic words --- 5

新学期なので基本的な言葉からはじめましょう。

species, evolution, speciation, extinction, biological diversity(=biodiversity)

上記の語を含む以下の文章を読んでみましょう。生物では基本的な知識なのではないでしょうか。

  The fact that millions of species are in existence today is evidence that speciation has clearly kept well ahead of extinction. In spite of the fact that there have been numerous periods of mass extinction, there is clear evidence that periods of mass extinction have been followed by periods of dramatic increases in new species to fill the void created by the mass extinctions, though it may take 10 million years or more following a mass extinction for biological diversity to be rebuilt through speciation. When the dinosaurs disappeared 65 million years ago, for example, the evolution and speciation of mammals increased spectacularly over the millions of years that ensued.

文法・語法的な問を一つ。上記の文で下線をほどこしたthatはそれぞれどのような役割を果たしているthatですか。